同源重組修復(Homologous Recombination Repair, HRR)是DNA雙鏈損傷的重要修復方式之一,HRR通路包含BRCA1/2基因。同源重組修復缺陷(Homologous Recombination Deficiency, HRD)的腫瘤細胞對含鉑化療和多聚ADP核糖聚合酶抑制劑(Poly ADP-ribose Polymerase inhibitor,PARPi)敏感。2014年至今,PARPi屢屢獲批應用于攜帶BRCA1/2變異腫瘤患者的臨床治療。2020年5月,FDA批準Olaparib聯用貝伐珠單抗應用于HRD陽性卵巢癌的一線維持治療,使Olaparib治療卵巢癌獲益人群從20%提升至50%。與此同時,PARPi伴隨診斷產品也相繼獲批,如Myriad Genetic的myChoice CDx和Foundation Medicine 的FoundationFocus CDx。其中myChoice CDx通過同源重組修復缺陷導致的三種“基因組瘢痕(genomic scar)”:雜合性缺失(LOH)、端粒等位不平衡(TAI)及大片段移位(LST)來判定基因組不穩定性的狀態,是目前業內公認的HRD評分規則。目前,國內PARPi用于HRD陽性卵巢癌的臨床試驗已獲批,IVD伴隨診斷產品的研發或藥物臨床試驗伴隨診斷產品的篩選,對標準品均有需求。
菁良科技HRD快速定制標準品來源于配對腫瘤細胞系,采用WGS數據評估標準品的HRD參考值,可滿足IVD市場上IVD企業參考品、試劑盒內陰陽性參考品、試劑盒性能驗證、日常質控和室間質評等應用需求。
配對永生化細胞系
可通過不同比例細胞系的混合模擬不同腫瘤純度
配套WGS數據及分析流程,可用于panel準確性驗證
通過WGS+雙樣本分析流程定值
HRD score 分布范圍廣,能模擬真實樣本
可定制gDNA/FFPE/ctDNA等形式標準品
評估實驗及分析流程的穩定性
檢驗HRD相關的LOH、LST、TAI每個獨立突變是否能準確判斷
WGS數據與HRD panel對比,檢驗Panel設計
腫瘤與野生型的不同混合比例可用于判斷每個突變的檢測極限,確定腫瘤最低比例
陰陽性參考品/質控品
產品形式(定制):gDNA、(ctDNA、FFPE蠟塊)
產品規格(定制):可根據需求定制
質控方法:數字PCR及其他
| 序號 | 產品編碼 | 產品名稱 | LOH | TAI | LST | HRD參考值(GW)* HRD-sum | 產品形式 | 濃度 | 規格 |
| 1 | GW-FGTM003-T | HRD-3-T gDNA參考品 | 18 | 6 | 10 | 34 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 |
| 2 | GW-FGTM003-N | HRD-3-N gDNA參考品 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 | ||||
| 3 | GW-FGTM005-T | HRD-5-T gDNA參考品 | 25 | 12 | 6 | 43 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 |
| 4 | GW-FGTM005-N | HRD-5-N gDNA參考品 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 | ||||
| 5 | GW-FGTM009-T | HRD-9-T gDNA參考品 | 6 | 26 | 20 | 52 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 |
| 6 | GW-FGTM009-N | HRD-9-N gDNA參考品 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 | ||||
| 7 | GW-FGTM002-T | HRD-2-T gDNA參考品 | 24 | 32 | 7 | 63 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 |
| 8 | GW-FGTM002-N | HRD-2-N gDNA參考品 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 | ||||
| 9 | GW-FGTM012-T | HRD-12-T gDNA參考品 | 35 | 35 | 24 | 94 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 |
| 10 | GW-FGTM012-N | HRD-12-N gDNA參考品 | gDNA | 30ng/μl | 1μg/管 |
以上產品我們也可提供上述腫瘤和正常細胞不同比例的混合樣本。如有其它HRD值的定制需求,亦可聯系技術支持或銷售團隊。